Innerhalb der ersten Minuten von Order 66 starben mehrere Mitglieder des Jedi-Rates. So wurde Plo Koon über Cato Neimoidia von Jag abgeschossen und Stass Allie auf Saleucami von Commander Neyo getötet. Aayla Secura wurde auf Felucia von Commander Bly und seinen Offizieren erschossen während Ki-Adi-Mundi auf Mygeeto von Commander Bacara und den Galactic Marines getötet wurde. Als Commander Cody auf Utapau Order 66 erhielt befahl er einem AT-TE auf Obi-Wan Kenobi zu feuern. Dieser überlebte allerdings den Angriff und stürzte mehrere Meter tief in einen See. Die folgende Suche nach Kenobis Leiche verlief allerdings ergebnislos. Auch Meister Yoda, der zum Zeitpunkt von Order 66 auf Kashyyyk war, überlebte da er Commander Gree und einen weiteren Trooper tötete als sie Order 66 ausführen wollten. Anschließend floh er mit Hilfe der Wookiees.

501. Klontruppengarnison:

Ungefähr ein Jahr nach der Schlacht von Geonosis, wurde eine Gruppe Klone von Kamino geholt und zusammen mit einigen Kaminoanischen Technikern nach Coruscant gebracht. Dort wurden sie zu den erfolgreichsten Klonen ausgebildet die es je gab, und zur 501. Legion geformt. Diese Elitegarnison wurde während der Klonkriege gegründet und war auf Corusant stationiert, wo Sie den galaktischen Senat und natürlich auch Kanzler Palpatine beschützen sollten. Die Elitekämpfer dieser 501. Legion hatten Rüstungen mit blauen Kennzeichen, die Sie deutlich von anderen Truppenteilen abhoben. Die Stärke der 501. lag darin, sehr gut koordinierte Mannschaftsmanöver während eines Gefechtes durchzuführen. Die Mitglieder waren allesamt hervorragende Schützen und fähige Klone.

Als reines Kampfkommando war es eines der Besten, dass die alte Republik bzw. das frühe Imperium je hatten, wenn man von der Masse an guten Soldaten ausgeht, die im Imperium ihren Dienst verrichteten. Die 501. war auf vielen Kriegsschauplätzen aktiv, unter anderem auch auf Mygeeto, Felucia, Utapau und Kashyyyk. Zu einer Ihrer spektakulärsten Mission zählte die Erstürmung des Jedi Tempels, kurz vor Ende der Klonkriege unter der Führung von Darth Vader. Mit dem Ziel die Jedi zu vernichten betraten die Klone den Jedi Tempel. Die Jedi erwiesen sich als sehr schwer zu töten und es gab hohe Verluste für die 501.Legion. Jedoch führte Sie Ihre Aufgabe zur Zufriedenheit Ihres Imperators aus. Nach ihrem Erfolg im Jedi-Tempel wurden die 501. Lord Vader persönlich unterstellt. Bald wurde 501. nur noch Vaders Faust genannt.